Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOBEC3AP31941 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3AP31941 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms