Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HOXD11P31277 AL157702.2-201ENST00000428292 1223 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD11P31277 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD11P31277 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD11P31277 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD11P31277 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HOXD11P31277 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD11P31277 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD11P31277 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD11P31277 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD11P31277 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD11P31277 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD11P31277 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD11P31277 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD11P31277 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD11P31277 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD11P31277 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD11P31277 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD11P31277 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD11P31277 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD11P31277 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD11P31277 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD11P31277 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD11P31277 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD11P31277 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD11P31277 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD11P31277 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD11P31277 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD11P31277 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD11P31277 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HOXD11P31277 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD11P31277 AC006511.4-201ENST00000631571 561 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD11P31277 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD11P31277 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD11P31277 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 AC108136.1-201ENST00000530350 631 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 AC006557.1-201ENST00000591211 1085 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 AL360268.1-201ENST00000453870 765 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 AC008840.1-201ENST00000512486 809 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 AC007991.4-201ENST00000522970 605 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 WT1-AS-206ENST00000525436 1254 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 HVCN1-209ENST00000620084 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 AC017002.5-201ENST00000630717 871 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms