Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC5P28715 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC5P28715 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms