Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCAP28676 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCAP28676 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCAP28676 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCAP28676 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCAP28676 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCAP28676 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCAP28676 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCAP28676 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCAP28676 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCAP28676 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCAP28676 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCAP28676 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCAP28676 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCAP28676 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCAP28676 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCAP28676 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCAP28676 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCAP28676 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCAP28676 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCAP28676 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCAP28676 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCAP28676 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCAP28676 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCAP28676 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCAP28676 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCAP28676 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCAP28676 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCAP28676 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCAP28676 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCAP28676 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCAP28676 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCAP28676 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCAP28676 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCAP28676 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCAP28676 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCAP28676 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCAP28676 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCAP28676 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCAP28676 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCAP28676 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCAP28676 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCAP28676 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCAP28676 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCAP28676 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCAP28676 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCAP28676 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCAP28676 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCAP28676 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCAP28676 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCAP28676 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCAP28676 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCAP28676 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCAP28676 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCAP28676 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCAP28676 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCAP28676 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCAP28676 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GCAP28676 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GCAP28676 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GCAP28676 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GCAP28676 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GCAP28676 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GCAP28676 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GCAP28676 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GCAP28676 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GCAP28676 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GCAP28676 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GCAP28676 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GCAP28676 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GCAP28676 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GCAP28676 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GCAP28676 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GCAP28676 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GCAP28676 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GCAP28676 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GCAP28676 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GCAP28676 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GCAP28676 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GCAP28676 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GCAP28676 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GCAP28676 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GCAP28676 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GCAP28676 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GCAP28676 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GCAP28676 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GCAP28676 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GCAP28676 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GCAP28676 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GCAP28676 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GCAP28676 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GCAP28676 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GCAP28676 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GCAP28676 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GCAP28676 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GCAP28676 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GCAP28676 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GCAP28676 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GCAP28676 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GCAP28676 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms