Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSMB5P28074 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSMB5P28074 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PSMB5P28074 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSMB5P28074 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSMB5P28074 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSMB5P28074 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSMB5P28074 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PSMB5P28074 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSMB5P28074 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSMB5P28074 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSMB5P28074 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSMB5P28074 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSMB5P28074 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSMB5P28074 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSMB5P28074 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSMB5P28074 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSMB5P28074 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSMB5P28074 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB5P28074 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB5P28074 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB5P28074 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB5P28074 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB5P28074 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB5P28074 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB5P28074 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB5P28074 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB5P28074 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB5P28074 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB5P28074 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB5P28074 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB5P28074 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB5P28074 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB5P28074 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB5P28074 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB5P28074 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB5P28074 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB5P28074 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB5P28074 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB5P28074 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB5P28074 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB5P28074 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB5P28074 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSMB5P28074 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSMB5P28074 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSMB5P28074 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSMB5P28074 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSMB5P28074 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSMB5P28074 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSMB5P28074 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSMB5P28074 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms