Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTNNA2P26232 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNA2P26232 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms