Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNE1P24864 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms