Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRKACBP22694 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRKACBP22694 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRKACBP22694 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRKACBP22694 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRKACBP22694 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRKACBP22694 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRKACBP22694 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRKACBP22694 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
PRKACBP22694 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
PRKACBP22694 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRKACBP22694 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRKACBP22694 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRKACBP22694 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms