Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCP2P22307 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCP2P22307 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCP2P22307 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCP2P22307 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SCP2P22307 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCP2P22307 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCP2P22307 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCP2P22307 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCP2P22307 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCP2P22307 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCP2P22307 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCP2P22307 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SCP2P22307 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SCP2P22307 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SCP2P22307 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCP2P22307 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SCP2P22307 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCP2P22307 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCP2P22307 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCP2P22307 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCP2P22307 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCP2P22307 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCP2P22307 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCP2P22307 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCP2P22307 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCP2P22307 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCP2P22307 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCP2P22307 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCP2P22307 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCP2P22307 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCP2P22307 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCP2P22307 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCP2P22307 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCP2P22307 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCP2P22307 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCP2P22307 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCP2P22307 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCP2P22307 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCP2P22307 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCP2P22307 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCP2P22307 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCP2P22307 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCP2P22307 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCP2P22307 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCP2P22307 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCP2P22307 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SCP2P22307 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCP2P22307 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCP2P22307 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCP2P22307 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCP2P22307 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCP2P22307 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCP2P22307 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCP2P22307 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCP2P22307 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCP2P22307 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SCP2P22307 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCP2P22307 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCP2P22307 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCP2P22307 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCP2P22307 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCP2P22307 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCP2P22307 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCP2P22307 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCP2P22307 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCP2P22307 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCP2P22307 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCP2P22307 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCP2P22307 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SCP2P22307 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCP2P22307 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCP2P22307 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCP2P22307 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCP2P22307 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCP2P22307 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCP2P22307 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCP2P22307 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCP2P22307 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCP2P22307 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCP2P22307 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCP2P22307 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCP2P22307 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCP2P22307 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCP2P22307 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCP2P22307 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCP2P22307 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCP2P22307 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCP2P22307 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCP2P22307 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCP2P22307 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCP2P22307 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCP2P22307 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCP2P22307 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCP2P22307 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCP2P22307 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCP2P22307 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCP2P22307 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCP2P22307 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCP2P22307 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms