Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCP20941 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCP20941 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCP20941 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCP20941 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCP20941 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCP20941 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCP20941 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCP20941 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCP20941 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCP20941 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCP20941 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCP20941 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCP20941 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCP20941 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCP20941 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCP20941 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCP20941 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCP20941 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCP20941 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCP20941 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCP20941 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCP20941 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCP20941 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCP20941 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCP20941 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCP20941 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCP20941 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCP20941 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCP20941 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCP20941 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCP20941 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCP20941 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCP20941 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDCP20941 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDCP20941 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDCP20941 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDCP20941 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDCP20941 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDCP20941 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDCP20941 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDCP20941 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDCP20941 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCP20941 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCP20941 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCP20941 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCP20941 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCP20941 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCP20941 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCP20941 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCP20941 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCP20941 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCP20941 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCP20941 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCP20941 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCP20941 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCP20941 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCP20941 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCP20941 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDCP20941 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDCP20941 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDCP20941 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PDCP20941 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDCP20941 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDCP20941 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDCP20941 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDCP20941 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDCP20941 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDCP20941 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDCP20941 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDCP20941 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDCP20941 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDCP20941 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDCP20941 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCP20941 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCP20941 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCP20941 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCP20941 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCP20941 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCP20941 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCP20941 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCP20941 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCP20941 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCP20941 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCP20941 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCP20941 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCP20941 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCP20941 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCP20941 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCP20941 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCP20941 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCP20941 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCP20941 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCP20941 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCP20941 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCP20941 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCP20941 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCP20941 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCP20941 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCP20941 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms