Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASTP20810 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASTP20810 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASTP20810 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASTP20810 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASTP20810 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASTP20810 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASTP20810 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CASTP20810 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CASTP20810 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASTP20810 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CASTP20810 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASTP20810 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASTP20810 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASTP20810 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASTP20810 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASTP20810 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASTP20810 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASTP20810 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASTP20810 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASTP20810 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASTP20810 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASTP20810 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASTP20810 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASTP20810 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASTP20810 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASTP20810 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASTP20810 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASTP20810 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASTP20810 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASTP20810 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASTP20810 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASTP20810 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASTP20810 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CASTP20810 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASTP20810 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CASTP20810 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASTP20810 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASTP20810 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASTP20810 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASTP20810 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASTP20810 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASTP20810 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASTP20810 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASTP20810 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASTP20810 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASTP20810 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASTP20810 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASTP20810 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CASTP20810 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASTP20810 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CASTP20810 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASTP20810 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASTP20810 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASTP20810 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASTP20810 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASTP20810 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASTP20810 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASTP20810 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASTP20810 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASTP20810 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASTP20810 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASTP20810 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASTP20810 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASTP20810 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASTP20810 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASTP20810 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASTP20810 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CASTP20810 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASTP20810 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASTP20810 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASTP20810 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASTP20810 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASTP20810 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASTP20810 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASTP20810 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASTP20810 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASTP20810 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CASTP20810 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASTP20810 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASTP20810 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASTP20810 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASTP20810 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASTP20810 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASTP20810 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASTP20810 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASTP20810 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASTP20810 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CASTP20810 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CASTP20810 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASTP20810 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASTP20810 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CASTP20810 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASTP20810 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASTP20810 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASTP20810 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASTP20810 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASTP20810 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASTP20810 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASTP20810 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms