Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM21P19474 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM21P19474 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms