Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms