Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD53P19397 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD53P19397 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD53P19397 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD53P19397 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD53P19397 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD53P19397 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD53P19397 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD53P19397 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD53P19397 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD53P19397 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD53P19397 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD53P19397 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD53P19397 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD53P19397 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD53P19397 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD53P19397 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD53P19397 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD53P19397 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD53P19397 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD53P19397 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD53P19397 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD53P19397 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD53P19397 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD53P19397 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CD53P19397 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD53P19397 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD53P19397 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD53P19397 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD53P19397 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD53P19397 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD53P19397 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD53P19397 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD53P19397 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD53P19397 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD53P19397 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD53P19397 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD53P19397 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CD53P19397 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CD53P19397 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CD53P19397 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CD53P19397 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD53P19397 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD53P19397 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD53P19397 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD53P19397 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD53P19397 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD53P19397 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD53P19397 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD53P19397 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD53P19397 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CD53P19397 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD53P19397 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CD53P19397 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD53P19397 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD53P19397 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD53P19397 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD53P19397 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD53P19397 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD53P19397 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD53P19397 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD53P19397 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD53P19397 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD53P19397 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD53P19397 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD53P19397 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD53P19397 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD53P19397 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD53P19397 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD53P19397 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD53P19397 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD53P19397 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD53P19397 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD53P19397 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD53P19397 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD53P19397 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CD53P19397 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD53P19397 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD53P19397 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD53P19397 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD53P19397 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD53P19397 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD53P19397 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD53P19397 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD53P19397 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD53P19397 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD53P19397 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD53P19397 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD53P19397 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD53P19397 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD53P19397 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD53P19397 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD53P19397 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CD53P19397 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD53P19397 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD53P19397 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD53P19397 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD53P19397 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD53P19397 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD53P19397 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms