Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATF3P18847 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATF3P18847 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ATF3P18847 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATF3P18847 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATF3P18847 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATF3P18847 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATF3P18847 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ATF3P18847 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ATF3P18847 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATF3P18847 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATF3P18847 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATF3P18847 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATF3P18847 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATF3P18847 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATF3P18847 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATF3P18847 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATF3P18847 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATF3P18847 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATF3P18847 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATF3P18847 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATF3P18847 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ATF3P18847 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATF3P18847 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATF3P18847 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATF3P18847 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATF3P18847 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATF3P18847 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATF3P18847 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ATF3P18847 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATF3P18847 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATF3P18847 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ATF3P18847 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATF3P18847 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATF3P18847 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATF3P18847 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATF3P18847 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATF3P18847 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATF3P18847 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATF3P18847 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATF3P18847 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATF3P18847 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATF3P18847 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATF3P18847 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATF3P18847 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATF3P18847 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATF3P18847 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATF3P18847 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATF3P18847 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATF3P18847 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATF3P18847 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATF3P18847 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ATF3P18847 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATF3P18847 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATF3P18847 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATF3P18847 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATF3P18847 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATF3P18847 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATF3P18847 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATF3P18847 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATF3P18847 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATF3P18847 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATF3P18847 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ATF3P18847 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ATF3P18847 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATF3P18847 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ATF3P18847 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATF3P18847 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATF3P18847 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATF3P18847 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATF3P18847 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATF3P18847 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATF3P18847 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ATF3P18847 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATF3P18847 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATF3P18847 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATF3P18847 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATF3P18847 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATF3P18847 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ATF3P18847 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATF3P18847 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATF3P18847 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATF3P18847 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATF3P18847 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATF3P18847 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATF3P18847 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATF3P18847 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATF3P18847 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATF3P18847 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ATF3P18847 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATF3P18847 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATF3P18847 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATF3P18847 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATF3P18847 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATF3P18847 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ATF3P18847 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATF3P18847 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATF3P18847 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATF3P18847 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATF3P18847 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms