Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCP1P17987 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TCP1P17987 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TCP1P17987 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCP1P17987 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCP1P17987 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCP1P17987 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCP1P17987 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCP1P17987 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCP1P17987 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCP1P17987 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCP1P17987 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TCP1P17987 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCP1P17987 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCP1P17987 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCP1P17987 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCP1P17987 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCP1P17987 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCP1P17987 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCP1P17987 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCP1P17987 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCP1P17987 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCP1P17987 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCP1P17987 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCP1P17987 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCP1P17987 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCP1P17987 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCP1P17987 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TCP1P17987 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCP1P17987 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCP1P17987 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCP1P17987 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCP1P17987 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCP1P17987 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TCP1P17987 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCP1P17987 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCP1P17987 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCP1P17987 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCP1P17987 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCP1P17987 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCP1P17987 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TCP1P17987 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCP1P17987 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCP1P17987 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCP1P17987 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCP1P17987 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCP1P17987 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCP1P17987 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCP1P17987 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCP1P17987 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCP1P17987 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCP1P17987 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCP1P17987 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCP1P17987 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCP1P17987 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCP1P17987 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCP1P17987 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCP1P17987 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCP1P17987 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCP1P17987 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCP1P17987 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCP1P17987 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCP1P17987 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCP1P17987 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCP1P17987 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCP1P17987 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TCP1P17987 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCP1P17987 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCP1P17987 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TCP1P17987 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCP1P17987 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCP1P17987 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCP1P17987 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCP1P17987 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCP1P17987 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCP1P17987 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCP1P17987 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCP1P17987 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCP1P17987 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCP1P17987 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCP1P17987 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCP1P17987 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCP1P17987 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCP1P17987 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TCP1P17987 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCP1P17987 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCP1P17987 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCP1P17987 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCP1P17987 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCP1P17987 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCP1P17987 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCP1P17987 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCP1P17987 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCP1P17987 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TCP1P17987 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TCP1P17987 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TCP1P17987 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TCP1P17987 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TCP1P17987 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TCP1P17987 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms