Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL3L1P16619 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms