Protein–RNA interactions for Protein: P13501

CCL5, C-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL5P13501 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCL5P13501 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCL5P13501 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCL5P13501 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCL5P13501 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCL5P13501 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCL5P13501 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCL5P13501 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCL5P13501 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCL5P13501 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL5P13501 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL5P13501 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL5P13501 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL5P13501 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL5P13501 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL5P13501 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL5P13501 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL5P13501 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL5P13501 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL5P13501 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL5P13501 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL5P13501 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL5P13501 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL5P13501 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL5P13501 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL5P13501 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL5P13501 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL5P13501 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL5P13501 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL5P13501 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL5P13501 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL5P13501 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL5P13501 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL5P13501 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL5P13501 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL5P13501 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL5P13501 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL5P13501 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL5P13501 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL5P13501 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL5P13501 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL5P13501 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL5P13501 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL5P13501 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL5P13501 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL5P13501 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL5P13501 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL5P13501 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL5P13501 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL5P13501 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL5P13501 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL5P13501 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL5P13501 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL5P13501 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL5P13501 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL5P13501 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL5P13501 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL5P13501 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL5P13501 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL5P13501 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL5P13501 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL5P13501 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL5P13501 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL5P13501 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL5P13501 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL5P13501 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL5P13501 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL5P13501 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL5P13501 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL5P13501 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL5P13501 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL5P13501 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL5P13501 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL5P13501 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL5P13501 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL5P13501 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL5P13501 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL5P13501 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL5P13501 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL5P13501 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL5P13501 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL5P13501 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL5P13501 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL5P13501 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL5P13501 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL5P13501 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL5P13501 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL5P13501 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL5P13501 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL5P13501 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL5P13501 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL5P13501 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL5P13501 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL5P13501 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCL5P13501 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL5P13501 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL5P13501 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL5P13501 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL5P13501 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL5P13501 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms