Protein–RNA interactions for Protein: P12107

COL11A1, Collagen alpha-1(XI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL11A1P12107 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL11A1P12107 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL11A1P12107 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL11A1P12107 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL11A1P12107 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL11A1P12107 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL11A1P12107 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL11A1P12107 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL11A1P12107 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL11A1P12107 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL11A1P12107 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL11A1P12107 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL11A1P12107 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL11A1P12107 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL11A1P12107 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL11A1P12107 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL11A1P12107 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL11A1P12107 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL11A1P12107 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL11A1P12107 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL11A1P12107 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL11A1P12107 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL11A1P12107 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL11A1P12107 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL11A1P12107 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL11A1P12107 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL11A1P12107 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL11A1P12107 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
COL11A1P12107 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
COL11A1P12107 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
COL11A1P12107 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL11A1P12107 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL11A1P12107 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL11A1P12107 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL11A1P12107 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL11A1P12107 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL11A1P12107 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL11A1P12107 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL11A1P12107 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL11A1P12107 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL11A1P12107 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL11A1P12107 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL11A1P12107 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL11A1P12107 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL11A1P12107 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL11A1P12107 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL11A1P12107 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL11A1P12107 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL11A1P12107 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL11A1P12107 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms