Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC35.93■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC35.92■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.92■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC35.88■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC35.88■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC35.85■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC35.85■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms