Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HKR1P10072 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HKR1P10072 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HKR1P10072 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HKR1P10072 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HKR1P10072 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HKR1P10072 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HKR1P10072 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HKR1P10072 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HKR1P10072 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HKR1P10072 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HKR1P10072 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HKR1P10072 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HKR1P10072 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HKR1P10072 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HKR1P10072 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HKR1P10072 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HKR1P10072 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HKR1P10072 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HKR1P10072 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HKR1P10072 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HKR1P10072 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HKR1P10072 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HKR1P10072 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HKR1P10072 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HKR1P10072 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HKR1P10072 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HKR1P10072 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HKR1P10072 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HKR1P10072 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HKR1P10072 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HKR1P10072 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HKR1P10072 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HKR1P10072 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HKR1P10072 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HKR1P10072 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HKR1P10072 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HKR1P10072 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HKR1P10072 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HKR1P10072 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HKR1P10072 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HKR1P10072 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HKR1P10072 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HKR1P10072 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HKR1P10072 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HKR1P10072 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HKR1P10072 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HKR1P10072 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HKR1P10072 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HKR1P10072 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HKR1P10072 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HKR1P10072 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HKR1P10072 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HKR1P10072 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HKR1P10072 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HKR1P10072 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HKR1P10072 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HKR1P10072 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HKR1P10072 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HKR1P10072 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HKR1P10072 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HKR1P10072 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HKR1P10072 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HKR1P10072 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HKR1P10072 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HKR1P10072 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HKR1P10072 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HKR1P10072 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HKR1P10072 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HKR1P10072 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HKR1P10072 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HKR1P10072 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HKR1P10072 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HKR1P10072 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HKR1P10072 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HKR1P10072 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HKR1P10072 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HKR1P10072 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HKR1P10072 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HKR1P10072 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HKR1P10072 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HKR1P10072 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HKR1P10072 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HKR1P10072 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HKR1P10072 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HKR1P10072 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HKR1P10072 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HKR1P10072 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HKR1P10072 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HKR1P10072 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HKR1P10072 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HKR1P10072 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HKR1P10072 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HKR1P10072 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HKR1P10072 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HKR1P10072 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HKR1P10072 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HKR1P10072 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HKR1P10072 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HKR1P10072 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms