Protein–RNA interactions for Protein: P0DL12

SMIM17, Small integral membrane protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM17P0DL12 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM17P0DL12 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM17P0DL12 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM17P0DL12 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM17P0DL12 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM17P0DL12 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM17P0DL12 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM17P0DL12 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM17P0DL12 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM17P0DL12 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM17P0DL12 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM17P0DL12 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM17P0DL12 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM17P0DL12 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM17P0DL12 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM17P0DL12 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM17P0DL12 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM17P0DL12 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM17P0DL12 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM17P0DL12 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms