Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAA2P0DJI9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAA2P0DJI9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SAA2P0DJI9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAA2P0DJI9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAA2P0DJI9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAA2P0DJI9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAA2P0DJI9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SAA2P0DJI9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SAA2P0DJI9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SAA2P0DJI9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SAA2P0DJI9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SAA2P0DJI9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAA2P0DJI9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms