Protein–RNA interactions for Protein: P0CX15

YRF1-7, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 7, yeastyeast

Predictions only

Length 1,859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-7P0CX15 ICS2YBR157C 768 nt0.75□□□□□ -2.29
YRF1-7P0CX15 TRS20YBR254C 528 nt0.75□□□□□ -2.29
YRF1-7P0CX15 YER147C-AYER147C-A 411 nt0.75□□□□□ -2.29
YRF1-7P0CX15 YGR290WYGR290W 444 nt0.75□□□□□ -2.29
YRF1-7P0CX15 YAP3YHL009C 993 nt0.75□□□□□ -2.29
YRF1-7P0CX15 NBL1YHR199C-A 222 nt0.75□□□□□ -2.29
YRF1-7P0CX15 YJL114WYJL114W 681 nt0.75□□□□□ -2.29
YRF1-7P0CX15 YJR071WYJR071W 369 nt0.75□□□□□ -2.29
YRF1-7P0CX15 UBX4YMR067C 1251 nt0.75□□□□□ -2.29
YRF1-7P0CX15 RUF20RUF20 443 nt0.75□□□□□ -2.29
YRF1-7P0CX15 YNL171CYNL171C 369 nt0.75□□□□□ -2.29
YRF1-7P0CX15 COX1Q0045 1605 nt0.74□□□□□ -2.29
YRF1-7P0CX15 MTC7YEL033W 420 nt0.74□□□□□ -2.29
YRF1-7P0CX15 NOP10YHR072W-A 177 nt0.74□□□□□ -2.29
YRF1-7P0CX15 YJL022WYJL022W 309 nt0.74□□□□□ -2.29
YRF1-7P0CX15 RPS10BYMR230W 318 nt0.74□□□□□ -2.29
YRF1-7P0CX15 SPP381YBR152W 876 nt0.74□□□□□ -2.29
YRF1-7P0CX15 CCE1YKL011C 1062 nt0.73□□□□□ -2.29
YRF1-7P0CX15 SMD3YLR147C 306 nt0.73□□□□□ -2.29
YRF1-7P0CX15 CYB5YNL111C 363 nt0.73□□□□□ -2.29
YRF1-7P0CX15 ECM25YJL201W 1800 nt0.73□□□□□ -2.29
YRF1-7P0CX15 BFA1YJR053W 1725 nt0.73□□□□□ -2.29
YRF1-7P0CX15 YDL157CYDL157C 357 nt0.73□□□□□ -2.29
YRF1-7P0CX15 YDR042CYDR042C 603 nt0.73□□□□□ -2.29
YRF1-7P0CX15 COX6YHR051W 447 nt0.73□□□□□ -2.29
YRF1-7P0CX15 AME1YBR211C 975 nt0.73□□□□□ -2.29
YRF1-7P0CX15 RKR1YMR247C 4689 nt0.73□□□□□ -2.29
YRF1-7P0CX15 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt0.72□□□□□ -2.29
YRF1-7P0CX15 AHC2YCR082W 387 nt0.72□□□□□ -2.29
YRF1-7P0CX15 YER088C-AYER088C-A 324 nt0.72□□□□□ -2.29
YRF1-7P0CX15 SWI6YLR182W 2412 nt0.72□□□□□ -2.29
YRF1-7P0CX15 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt0.71□□□□□ -2.3
YRF1-7P0CX15 HOP2YGL033W 657 nt0.71□□□□□ -2.3
YRF1-7P0CX15 PRS3YHL011C 963 nt0.71□□□□□ -2.3
YRF1-7P0CX15 IMP3YHR148W 552 nt0.71□□□□□ -2.3
YRF1-7P0CX15 ESA1YOR244W 1338 nt0.71□□□□□ -2.3
YRF1-7P0CX15 NUP120YKL057C 3114 nt0.71□□□□□ -2.3
YRF1-7P0CX15 SNA4YDL123W 423 nt0.71□□□□□ -2.3
YRF1-7P0CX15 YDR262WYDR262W 819 nt0.71□□□□□ -2.3
YRF1-7P0CX15 YIP1YGR172C 747 nt0.71□□□□□ -2.3
YRF1-7P0CX15 YKE2YLR200W 345 nt0.71□□□□□ -2.3
YRF1-7P0CX15 YNL010WYNL010W 726 nt0.71□□□□□ -2.3
YRF1-7P0CX15 YGR250CYGR250C 2346 nt0.7□□□□□ -2.3
YRF1-7P0CX15 BEM3YPL115C 3387 nt0.7□□□□□ -2.3
YRF1-7P0CX15 AZF1YOR113W 2745 nt0.7□□□□□ -2.3
YRF1-7P0CX15 YBP2YGL060W 1926 nt0.7□□□□□ -2.3
YRF1-7P0CX15 SEC1YDR164C 2175 nt0.7□□□□□ -2.3
YRF1-7P0CX15 SLK19YOR195W 2466 nt0.7□□□□□ -2.3
YRF1-7P0CX15 FAR3YMR052W 615 nt0.69□□□□□ -2.3
YRF1-7P0CX15 SNC2YOR327C 348 nt0.69□□□□□ -2.3
YRF1-7P0CX15 MGR1YCL044C 1254 nt0.69□□□□□ -2.3
YRF1-7P0CX15 DGR2YKL121W 2559 nt0.69□□□□□ -2.3
YRF1-7P0CX15 BI3Q0115 1554 nt0.69□□□□□ -2.3
YRF1-7P0CX15 RPI1YIL119C 1224 nt0.69□□□□□ -2.3
YRF1-7P0CX15 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt0.69□□□□□ -2.3
YRF1-7P0CX15 YKL115CYKL115C 393 nt0.69□□□□□ -2.3
YRF1-7P0CX15 NEJ1YLR265C 1029 nt0.69□□□□□ -2.3
YRF1-7P0CX15 NCL1YBL024W 2055 nt0.69□□□□□ -2.3
YRF1-7P0CX15 SHS1YDL225W 1656 nt0.68□□□□□ -2.3
YRF1-7P0CX15 ALK1YGL021W 2283 nt0.68□□□□□ -2.3
YRF1-7P0CX15 RPL40AYIL148W 387 nt0.68□□□□□ -2.3
YRF1-7P0CX15 SDL1YIL167W 633 nt0.68□□□□□ -2.3
YRF1-7P0CX15 RPS18BYML026C 441 nt0.68□□□□□ -2.3
YRF1-7P0CX15 NCA2YPR155C 1851 nt0.68□□□□□ -2.3
YRF1-7P0CX15 MUK1YPL070W 1839 nt0.68□□□□□ -2.3
YRF1-7P0CX15 TAP42YMR028W 1101 nt0.67□□□□□ -2.3
YRF1-7P0CX15 SPC24YMR117C 642 nt0.67□□□□□ -2.3
YRF1-7P0CX15 FMP23YBR047W 528 nt0.67□□□□□ -2.3
YRF1-7P0CX15 SAS3YBL052C 2496 nt0.67□□□□□ -2.3
YRF1-7P0CX15 DAS1YJL149W 1992 nt0.67□□□□□ -2.3
YRF1-7P0CX15 BTN2YGR142W 1233 nt0.67□□□□□ -2.3
YRF1-7P0CX15 YLR031WYLR031W 561 nt0.67□□□□□ -2.3
YRF1-7P0CX15 MVP1YMR004W 1536 nt0.66□□□□□ -2.3
YRF1-7P0CX15 COG8YML071C 1824 nt0.66□□□□□ -2.3
YRF1-7P0CX15 PPN1YDR452W 2025 nt0.66□□□□□ -2.3
YRF1-7P0CX15 GOS1YHL031C 672 nt0.65□□□□□ -2.3
YRF1-7P0CX15 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt0.65□□□□□ -2.3
YRF1-7P0CX15 CUR1YPR158W 759 nt0.65□□□□□ -2.3
YRF1-7P0CX15 NTC20YBR188C 423 nt0.65□□□□□ -2.3
YRF1-7P0CX15 YJR029WYJR029W 5268 nt0.65□□□□□ -2.31
YRF1-7P0CX15 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.65□□□□□ -2.31
YRF1-7P0CX15 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt0.65□□□□□ -2.31
YRF1-7P0CX15 RFA3YJL173C 369 nt0.64□□□□□ -2.31
YRF1-7P0CX15 YBR224WYBR224W 516 nt0.64□□□□□ -2.31
YRF1-7P0CX15 YML002WYML002W 2214 nt0.64□□□□□ -2.31
YRF1-7P0CX15 POP6YGR030C 477 nt0.63□□□□□ -2.31
YRF1-7P0CX15 GIC1YHR061C 945 nt0.63□□□□□ -2.31
YRF1-7P0CX15 YJL032WYJL032W 315 nt0.63□□□□□ -2.31
YRF1-7P0CX15 LSM7YNL147W 348 nt0.63□□□□□ -2.31
YRF1-7P0CX15 MSC6YOR354C 2079 nt0.63□□□□□ -2.31
YRF1-7P0CX15 PRP39YML046W 1890 nt0.63□□□□□ -2.31
YRF1-7P0CX15 TMA20YER007C-A 546 nt0.63□□□□□ -2.31
YRF1-7P0CX15 HSK3YKL138C-A 210 nt0.63□□□□□ -2.31
YRF1-7P0CX15 TIF11YMR260C 462 nt0.63□□□□□ -2.31
YRF1-7P0CX15 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt0.63□□□□□ -2.31
YRF1-7P0CX15 YBR062CYBR062C 543 nt0.63□□□□□ -2.31
YRF1-7P0CX15 UBC9YDL064W 474 nt0.62□□□□□ -2.31
YRF1-7P0CX15 PFS1YHR185C 714 nt0.62□□□□□ -2.31
YRF1-7P0CX15 RRP15YPR143W 753 nt0.62□□□□□ -2.31
YRF1-7P0CX15 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt0.61□□□□□ -2.31
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