Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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FAM200BP0CF97 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM200BP0CF97 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM200BP0CF97 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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