Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSF1RP07333 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CSF1RP07333 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms