Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYCNP04198 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYCNP04198 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYCNP04198 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYCNP04198 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYCNP04198 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYCNP04198 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYCNP04198 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYCNP04198 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYCNP04198 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYCNP04198 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYCNP04198 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYCNP04198 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYCNP04198 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYCNP04198 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYCNP04198 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MYCNP04198 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYCNP04198 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYCNP04198 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYCNP04198 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYCNP04198 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYCNP04198 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYCNP04198 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MYCNP04198 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYCNP04198 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYCNP04198 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYCNP04198 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYCNP04198 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYCNP04198 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYCNP04198 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYCNP04198 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYCNP04198 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYCNP04198 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYCNP04198 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYCNP04198 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYCNP04198 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYCNP04198 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYCNP04198 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYCNP04198 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYCNP04198 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYCNP04198 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MYCNP04198 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYCNP04198 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYCNP04198 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYCNP04198 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYCNP04198 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYCNP04198 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYCNP04198 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYCNP04198 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MYCNP04198 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MYCNP04198 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MYCNP04198 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MYCNP04198 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MYCNP04198 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MYCNP04198 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MYCNP04198 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYCNP04198 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYCNP04198 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYCNP04198 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYCNP04198 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYCNP04198 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYCNP04198 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYCNP04198 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYCNP04198 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYCNP04198 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYCNP04198 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYCNP04198 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MYCNP04198 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MYCNP04198 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYCNP04198 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYCNP04198 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYCNP04198 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYCNP04198 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYCNP04198 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYCNP04198 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYCNP04198 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYCNP04198 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYCNP04198 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYCNP04198 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MYCNP04198 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYCNP04198 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYCNP04198 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MYCNP04198 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYCNP04198 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYCNP04198 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYCNP04198 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYCNP04198 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYCNP04198 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYCNP04198 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYCNP04198 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MYCNP04198 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYCNP04198 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYCNP04198 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYCNP04198 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYCNP04198 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYCNP04198 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYCNP04198 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYCNP04198 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYCNP04198 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MYCNP04198 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms