Protein–RNA interactions for Protein: P01880

IGHD, Immunoglobulin heavy constant delta, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHDP01880 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IGHDP01880 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IGHDP01880 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IGHDP01880 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
IGHDP01880 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IGHDP01880 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IGHDP01880 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IGHDP01880 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IGHDP01880 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IGHDP01880 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IGHDP01880 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IGHDP01880 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IGHDP01880 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IGHDP01880 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IGHDP01880 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IGHDP01880 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IGHDP01880 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IGHDP01880 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IGHDP01880 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IGHDP01880 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IGHDP01880 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IGHDP01880 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IGHDP01880 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IGHDP01880 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IGHDP01880 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IGHDP01880 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IGHDP01880 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IGHDP01880 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IGHDP01880 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IGHDP01880 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IGHDP01880 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IGHDP01880 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
IGHDP01880 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IGHDP01880 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IGHDP01880 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IGHDP01880 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
IGHDP01880 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IGHDP01880 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IGHDP01880 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IGHDP01880 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IGHDP01880 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IGHDP01880 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IGHDP01880 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IGHDP01880 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
IGHDP01880 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IGHDP01880 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IGHDP01880 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IGHDP01880 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IGHDP01880 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IGHDP01880 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IGHDP01880 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IGHDP01880 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IGHDP01880 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGHDP01880 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGHDP01880 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGHDP01880 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGHDP01880 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGHDP01880 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGHDP01880 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGHDP01880 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGHDP01880 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGHDP01880 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGHDP01880 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGHDP01880 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGHDP01880 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGHDP01880 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGHDP01880 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGHDP01880 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGHDP01880 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGHDP01880 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGHDP01880 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGHDP01880 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGHDP01880 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGHDP01880 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGHDP01880 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGHDP01880 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IGHDP01880 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IGHDP01880 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IGHDP01880 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IGHDP01880 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IGHDP01880 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IGHDP01880 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
IGHDP01880 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IGHDP01880 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IGHDP01880 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IGHDP01880 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IGHDP01880 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IGHDP01880 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
IGHDP01880 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IGHDP01880 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IGHDP01880 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IGHDP01880 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IGHDP01880 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IGHDP01880 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IGHDP01880 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IGHDP01880 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IGHDP01880 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IGHDP01880 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IGHDP01880 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IGHDP01880 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms