Protein–RNA interactions for Protein: P00558

PGK1, Phosphoglycerate kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGK1P00558 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PGK1P00558 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGK1P00558 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGK1P00558 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGK1P00558 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGK1P00558 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGK1P00558 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGK1P00558 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGK1P00558 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGK1P00558 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGK1P00558 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGK1P00558 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGK1P00558 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGK1P00558 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGK1P00558 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGK1P00558 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGK1P00558 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGK1P00558 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGK1P00558 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGK1P00558 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGK1P00558 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGK1P00558 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGK1P00558 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGK1P00558 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGK1P00558 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGK1P00558 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGK1P00558 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGK1P00558 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGK1P00558 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGK1P00558 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGK1P00558 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGK1P00558 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PGK1P00558 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGK1P00558 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGK1P00558 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGK1P00558 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGK1P00558 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGK1P00558 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGK1P00558 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGK1P00558 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGK1P00558 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGK1P00558 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PGK1P00558 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PGK1P00558 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGK1P00558 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGK1P00558 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PGK1P00558 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGK1P00558 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGK1P00558 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PGK1P00558 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PGK1P00558 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGK1P00558 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGK1P00558 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGK1P00558 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGK1P00558 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGK1P00558 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGK1P00558 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGK1P00558 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGK1P00558 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGK1P00558 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGK1P00558 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGK1P00558 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGK1P00558 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGK1P00558 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PGK1P00558 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGK1P00558 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PGK1P00558 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGK1P00558 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGK1P00558 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGK1P00558 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGK1P00558 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PGK1P00558 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGK1P00558 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGK1P00558 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGK1P00558 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGK1P00558 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PGK1P00558 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PGK1P00558 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PGK1P00558 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PGK1P00558 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PGK1P00558 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGK1P00558 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PGK1P00558 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGK1P00558 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGK1P00558 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGK1P00558 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGK1P00558 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGK1P00558 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGK1P00558 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGK1P00558 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGK1P00558 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGK1P00558 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGK1P00558 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGK1P00558 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGK1P00558 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGK1P00558 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGK1P00558 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGK1P00558 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGK1P00558 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGK1P00558 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110 ms