Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KIF4AO95239 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms