Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOL3O95236 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOL3O95236 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOL3O95236 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOL3O95236 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOL3O95236 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOL3O95236 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOL3O95236 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOL3O95236 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOL3O95236 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
APOL3O95236 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOL3O95236 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOL3O95236 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOL3O95236 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOL3O95236 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOL3O95236 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOL3O95236 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOL3O95236 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOL3O95236 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOL3O95236 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOL3O95236 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOL3O95236 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOL3O95236 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOL3O95236 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOL3O95236 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOL3O95236 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOL3O95236 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOL3O95236 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOL3O95236 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOL3O95236 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOL3O95236 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOL3O95236 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOL3O95236 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOL3O95236 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOL3O95236 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL3O95236 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL3O95236 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL3O95236 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL3O95236 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL3O95236 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL3O95236 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL3O95236 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL3O95236 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL3O95236 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL3O95236 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL3O95236 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL3O95236 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL3O95236 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL3O95236 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL3O95236 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL3O95236 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL3O95236 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL3O95236 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL3O95236 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL3O95236 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL3O95236 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL3O95236 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL3O95236 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL3O95236 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL3O95236 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL3O95236 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL3O95236 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL3O95236 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL3O95236 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL3O95236 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL3O95236 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL3O95236 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL3O95236 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL3O95236 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL3O95236 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL3O95236 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL3O95236 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL3O95236 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL3O95236 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL3O95236 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL3O95236 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL3O95236 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL3O95236 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL3O95236 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL3O95236 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL3O95236 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL3O95236 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOL3O95236 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOL3O95236 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOL3O95236 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOL3O95236 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOL3O95236 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOL3O95236 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOL3O95236 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL3O95236 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL3O95236 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL3O95236 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL3O95236 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL3O95236 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL3O95236 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL3O95236 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL3O95236 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL3O95236 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL3O95236 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL3O95236 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms