Protein–RNA interactions for Protein: O75762

TRPA1, Transient receptor potential cation channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPA1O75762 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRPA1O75762 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms