Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BRD4O60885 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BRD4O60885 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BRD4O60885 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BRD4O60885 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRD4O60885 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRD4O60885 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRD4O60885 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRD4O60885 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRD4O60885 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRD4O60885 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRD4O60885 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRD4O60885 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRD4O60885 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRD4O60885 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRD4O60885 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRD4O60885 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRD4O60885 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRD4O60885 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRD4O60885 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRD4O60885 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRD4O60885 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRD4O60885 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRD4O60885 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRD4O60885 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRD4O60885 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BRD4O60885 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BRD4O60885 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BRD4O60885 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BRD4O60885 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BRD4O60885 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BRD4O60885 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BRD4O60885 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BRD4O60885 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BRD4O60885 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BRD4O60885 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BRD4O60885 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BRD4O60885 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BRD4O60885 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BRD4O60885 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BRD4O60885 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BRD4O60885 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BRD4O60885 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BRD4O60885 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BRD4O60885 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BRD4O60885 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BRD4O60885 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BRD4O60885 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BRD4O60885 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BRD4O60885 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
BRD4O60885 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BRD4O60885 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRD4O60885 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRD4O60885 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRD4O60885 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRD4O60885 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRD4O60885 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRD4O60885 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRD4O60885 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRD4O60885 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRD4O60885 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRD4O60885 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRD4O60885 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRD4O60885 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRD4O60885 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRD4O60885 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BRD4O60885 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BRD4O60885 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
BRD4O60885 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
BRD4O60885 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
BRD4O60885 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BRD4O60885 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
BRD4O60885 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
BRD4O60885 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
BRD4O60885 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BRD4O60885 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BRD4O60885 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BRD4O60885 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
BRD4O60885 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BRD4O60885 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BRD4O60885 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BRD4O60885 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BRD4O60885 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BRD4O60885 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BRD4O60885 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRD4O60885 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRD4O60885 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRD4O60885 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRD4O60885 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRD4O60885 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRD4O60885 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
BRD4O60885 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRD4O60885 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRD4O60885 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRD4O60885 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRD4O60885 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRD4O60885 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRD4O60885 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRD4O60885 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRD4O60885 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms