Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA2O43921 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms