Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VEGFDO43915 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VEGFDO43915 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VEGFDO43915 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VEGFDO43915 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VEGFDO43915 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VEGFDO43915 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VEGFDO43915 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VEGFDO43915 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VEGFDO43915 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VEGFDO43915 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VEGFDO43915 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
VEGFDO43915 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VEGFDO43915 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VEGFDO43915 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VEGFDO43915 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms