Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRKAB2O43741 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms