Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HTATSF1O43719 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HTATSF1O43719 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms