Protein–RNA interactions for Protein: O43610

SPRY3, Protein sprouty homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY3O43610 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPRY3O43610 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPRY3O43610 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPRY3O43610 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPRY3O43610 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SPRY3O43610 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPRY3O43610 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPRY3O43610 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SPRY3O43610 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPRY3O43610 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPRY3O43610 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SPRY3O43610 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPRY3O43610 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPRY3O43610 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPRY3O43610 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPRY3O43610 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SPRY3O43610 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPRY3O43610 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPRY3O43610 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPRY3O43610 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPRY3O43610 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPRY3O43610 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPRY3O43610 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPRY3O43610 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPRY3O43610 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPRY3O43610 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPRY3O43610 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPRY3O43610 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms