Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXA3O43365 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA3O43365 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms