Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms