Protein–RNA interactions for Protein: O15551

CLDN3, Claudin-3, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3O15551 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLDN3O15551 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN3O15551 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms