Protein–RNA interactions for Protein: O15399

GRIN2D, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2D, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2DO15399 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIN2DO15399 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms