Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD28O15084 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD28O15084 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD28O15084 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD28O15084 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD28O15084 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD28O15084 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD28O15084 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD28O15084 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD28O15084 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD28O15084 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD28O15084 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD28O15084 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD28O15084 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD28O15084 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD28O15084 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD28O15084 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD28O15084 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD28O15084 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD28O15084 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD28O15084 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD28O15084 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD28O15084 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD28O15084 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD28O15084 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD28O15084 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD28O15084 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD28O15084 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD28O15084 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD28O15084 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD28O15084 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD28O15084 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD28O15084 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD28O15084 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD28O15084 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD28O15084 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD28O15084 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ANKRD28O15084 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ANKRD28O15084 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ANKRD28O15084 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ANKRD28O15084 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ANKRD28O15084 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ANKRD28O15084 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ANKRD28O15084 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ANKRD28O15084 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD28O15084 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms