Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYNMO15061 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYNMO15061 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYNMO15061 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYNMO15061 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYNMO15061 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SYNMO15061 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYNMO15061 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYNMO15061 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYNMO15061 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SYNMO15061 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYNMO15061 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYNMO15061 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYNMO15061 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYNMO15061 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SYNMO15061 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYNMO15061 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYNMO15061 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYNMO15061 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYNMO15061 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYNMO15061 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYNMO15061 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYNMO15061 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYNMO15061 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYNMO15061 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYNMO15061 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYNMO15061 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYNMO15061 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYNMO15061 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
SYNMO15061 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYNMO15061 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
SYNMO15061 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYNMO15061 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYNMO15061 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SYNMO15061 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SYNMO15061 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SYNMO15061 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SYNMO15061 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SYNMO15061 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SYNMO15061 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SYNMO15061 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SYNMO15061 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SYNMO15061 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SYNMO15061 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SYNMO15061 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SYNMO15061 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SYNMO15061 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SYNMO15061 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SYNMO15061 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SYNMO15061 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SYNMO15061 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SYNMO15061 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SYNMO15061 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SYNMO15061 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SYNMO15061 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SYNMO15061 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SYNMO15061 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SYNMO15061 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SYNMO15061 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SYNMO15061 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SYNMO15061 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SYNMO15061 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SYNMO15061 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SYNMO15061 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SYNMO15061 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SYNMO15061 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SYNMO15061 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SYNMO15061 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SYNMO15061 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SYNMO15061 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SYNMO15061 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SYNMO15061 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SYNMO15061 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SYNMO15061 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SYNMO15061 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SYNMO15061 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SYNMO15061 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SYNMO15061 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SYNMO15061 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SYNMO15061 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SYNMO15061 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SYNMO15061 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SYNMO15061 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYNMO15061 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYNMO15061 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYNMO15061 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SYNMO15061 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYNMO15061 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYNMO15061 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYNMO15061 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYNMO15061 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYNMO15061 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYNMO15061 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SYNMO15061 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SYNMO15061 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SYNMO15061 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SYNMO15061 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SYNMO15061 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SYNMO15061 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SYNMO15061 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms