Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IKBKBO14920 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IKBKBO14920 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms