Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
APAF1O14727 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
APAF1O14727 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
APAF1O14727 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
APAF1O14727 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
APAF1O14727 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
APAF1O14727 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
APAF1O14727 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
APAF1O14727 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
APAF1O14727 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
APAF1O14727 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
APAF1O14727 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
APAF1O14727 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
APAF1O14727 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
APAF1O14727 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
APAF1O14727 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
APAF1O14727 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
APAF1O14727 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
APAF1O14727 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
APAF1O14727 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
APAF1O14727 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
APAF1O14727 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
APAF1O14727 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
APAF1O14727 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
APAF1O14727 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
APAF1O14727 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
APAF1O14727 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
APAF1O14727 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
APAF1O14727 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
APAF1O14727 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
APAF1O14727 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
APAF1O14727 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
APAF1O14727 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
APAF1O14727 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
APAF1O14727 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
APAF1O14727 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
APAF1O14727 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
APAF1O14727 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
APAF1O14727 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
APAF1O14727 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
APAF1O14727 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
APAF1O14727 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
APAF1O14727 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
APAF1O14727 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
APAF1O14727 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
APAF1O14727 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
APAF1O14727 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
APAF1O14727 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
APAF1O14727 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
APAF1O14727 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
APAF1O14727 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
APAF1O14727 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
APAF1O14727 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
APAF1O14727 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
APAF1O14727 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
APAF1O14727 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
APAF1O14727 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
APAF1O14727 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
APAF1O14727 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
APAF1O14727 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
APAF1O14727 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
APAF1O14727 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
APAF1O14727 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
APAF1O14727 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
APAF1O14727 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
APAF1O14727 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
APAF1O14727 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
APAF1O14727 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
APAF1O14727 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
APAF1O14727 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
APAF1O14727 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
APAF1O14727 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
APAF1O14727 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
APAF1O14727 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
APAF1O14727 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
APAF1O14727 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
APAF1O14727 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
APAF1O14727 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
APAF1O14727 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
APAF1O14727 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
APAF1O14727 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
APAF1O14727 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
APAF1O14727 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
APAF1O14727 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
APAF1O14727 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
APAF1O14727 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
APAF1O14727 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
APAF1O14727 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
APAF1O14727 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
APAF1O14727 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
APAF1O14727 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
APAF1O14727 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
APAF1O14727 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
APAF1O14727 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
APAF1O14727 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
APAF1O14727 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
APAF1O14727 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
APAF1O14727 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
APAF1O14727 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
APAF1O14727 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms