Protein–RNA interactions for Protein: O14543

SOCS3, Suppressor of cytokine signaling 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS3O14543 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms