Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 TCEAL4-207ENST00000469586 566 ntTSL 28.64□□□□□ -1.035e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 FXYD1-201ENST00000351325 592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.045e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 FAM47E-STBD1-202ENST00000514140 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 28.25□□□□□ -1.095e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 NDRG2-229ENST00000554379 553 ntTSL 47.64□□□□□ -1.195e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 ATP5EP2-201ENST00000381026 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.321e-13■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.415e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 DAB2-210ENST00000509457 280 ntTSL 45.65□□□□□ -1.55e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 TWF1-209ENST00000550371 612 ntTSL 35.64□□□□□ -1.515e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 EIF3L-208ENST00000451427 583 ntTSL 45.6□□□□□ -1.513e-29■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.512e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 MRPL13-204ENST00000520677 500 ntTSL 35.43□□□□□ -1.543e-14■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.713e-8■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 KCMF1-202ENST00000428691 560 ntTSL 218.86■□□□□ 0.615e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 KCMF1-203ENST00000453448 625 ntTSL 35.9□□□□□ -1.465e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 POLR2C-206ENST00000564626 518 ntTSL 27.82□□□□□ -1.166e-15■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.355e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.139e-8■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 TMEM2-212ENST00000545719 533 ntTSL 44.92□□□□□ -1.629e-8■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.752e-21■■■■■ 34.4
DDX3XO00571 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.686e-10■■■■■ 34.4
DDX3XO00571 ZDHHC3-208ENST00000455235 537 ntTSL 425■■□□□ 1.596e-10■■■■■ 34.4
DDX3XO00571 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.946e-10■■■■■ 34.4
DDX3XO00571 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.116e-10■■■■■ 34.4
DDX3XO00571 HSPA4-204ENST00000615899 2204 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.144e-28■■■■■ 34.4
DDX3XO00571 NDUFS2-214ENST00000496133 815 ntTSL 522.3■■□□□ 1.161e-20■■■■■ 34.4
DDX3XO00571 NDUFS2-204ENST00000467295 1060 ntTSL 321.22■□□□□ 0.991e-20■■■■■ 34.4
DDX3XO00571 NDUFS2-215ENST00000496553 888 ntTSL 221.22■□□□□ 0.991e-20■■■■■ 34.4
DDX3XO00571 NDUFS2-207ENST00000475570 506 ntTSL 221.1■□□□□ 0.971e-20■■■■■ 34.4
DDX3XO00571 NDUFS2-208ENST00000478866 1076 ntTSL 220.18■□□□□ 0.821e-20■■■■■ 34.4
DDX3XO00571 NDUFS2-209ENST00000479948 681 ntTSL 317.77■□□□□ 0.441e-20■■■■■ 34.4
DDX3XO00571 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41e-20■■■■■ 34.4
DDX3XO00571 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.281e-20■■■■■ 34.4
DDX3XO00571 TIMM22-201ENST00000327158 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.311e-19■■■■■ 34.4
DDX3XO00571 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.383e-16■■■■■ 34.4
DDX3XO00571 WBP1L-202ENST00000448841 4085 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.333e-8■■■■■ 34.4
DDX3XO00571 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 14e-18■■■■■ 34.4
DDX3XO00571 SMYD2-203ENST00000460580 1618 ntTSL 1 (best)20.65■□□□□ 0.94e-18■■■■■ 34.4
DDX3XO00571 SMYD2-204ENST00000471645 4732 ntTSL 1 (best)15.41■□□□□ 0.064e-18■■■■■ 34.4
DDX3XO00571 SMYD2-206ENST00000491455 3809 ntTSL 214.19□□□□□ -0.144e-18■■■■■ 34.4
DDX3XO00571 BCL7B-208ENST00000464288 653 ntTSL 321.96■■□□□ 1.111e-8■■■■■ 34.4
DDX3XO00571 BCL7B-212ENST00000493592 582 ntTSL 313.94□□□□□ -0.181e-8■■■■■ 34.4
DDX3XO00571 BCL7B-207ENST00000463858 714 ntTSL 313.88□□□□□ -0.191e-8■■■■■ 34.4
DDX3XO00571 BCL7B-210ENST00000482231 1638 ntTSL 213□□□□□ -0.331e-8■■■■■ 34.4
DDX3XO00571 CENPX-209ENST00000584514 882 ntTSL 219.32■□□□□ 0.685e-16■■■■■ 34.4
DDX3XO00571 PHB-209ENST00000508009 451 ntTSL 57.46□□□□□ -1.222e-21■■■■■ 34.4
DDX3XO00571 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.271e-12■■■■■ 34.4
DDX3XO00571 DDX19A-205ENST00000562509 564 ntTSL 217.32■□□□□ 0.362e-21■■■■■ 34.3
DDX3XO00571 DDX19A-207ENST00000565195 586 ntTSL 217.29■□□□□ 0.362e-21■■■■■ 34.3
DDX3XO00571 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.192e-21■■■■■ 34.3
DDX3XO00571 DDX19A-203ENST00000561574 577 ntTSL 415.98■□□□□ 0.152e-21■■■■■ 34.3
DDX3XO00571 DDX19A-212ENST00000569244 557 ntTSL 415.77■□□□□ 0.122e-21■■■■■ 34.3
DDX3XO00571 DDX19A-213ENST00000569319 1643 ntTSL 1 (best)15.7■□□□□ 0.12e-21■■■■■ 34.3
DDX3XO00571 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.12e-21■■■■■ 34.3
DDX3XO00571 DDX19A-206ENST00000562649 557 ntTSL 515.39■□□□□ 0.052e-21■■■■■ 34.3
DDX3XO00571 DDX19A-208ENST00000566167 551 ntTSL 513.79□□□□□ -0.22e-21■■■■■ 34.3
DDX3XO00571 DDX19A-201ENST00000302243 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.462e-21■■■■■ 34.3
DDX3XO00571 DDX19A-214ENST00000569771 3067 ntTSL 1 (best)11.19□□□□□ -0.622e-21■■■■■ 34.3
DDX3XO00571 AC012184.2-201ENST00000565116 565 ntTSL 510.54□□□□□ -0.722e-21■■■■■ 34.3
DDX3XO00571 AC012184.2-202ENST00000567706 867 ntTSL 59.13□□□□□ -0.952e-21■■■■■ 34.3
DDX3XO00571 ST6GALNAC4-206ENST00000483438 505 ntTSL 219.63■□□□□ 0.733e-6■■■■■ 34.3
DDX3XO00571 ST6GALNAC4-207ENST00000495983 1362 ntTSL 517.47■□□□□ 0.393e-6■■■■■ 34.3
DDX3XO00571 ADPGK-203ENST00000562286 556 ntTSL 419.57■□□□□ 0.721e-6■■■■■ 34.3
DDX3XO00571 ADPGK-206ENST00000563907 1041 ntTSL 317.33■□□□□ 0.361e-6■■■■■ 34.3
DDX3XO00571 ADPGK-209ENST00000567733 525 ntTSL 513.92□□□□□ -0.181e-6■■■■■ 34.3
DDX3XO00571 HAGHL-214ENST00000567414 735 ntTSL 220.4■□□□□ 0.865e-12■■■■■ 34.3
DDX3XO00571 HAGHL-207ENST00000561750 675 ntTSL 219.71■□□□□ 0.755e-12■■■■■ 34.3
DDX3XO00571 HAGHL-216ENST00000568141 740 ntTSL 217.95■□□□□ 0.465e-12■■■■■ 34.3
DDX3XO00571 MSRB1-204ENST00000489198 709 ntTSL 312.39□□□□□ -0.436e-21■■■■■ 34.3
DDX3XO00571 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.139e-9■■■■■ 34.3
DDX3XO00571 MCAM-214ENST00000530144 909 ntTSL 321.63■■□□□ 1.053e-14■■■■■ 34.3
DDX3XO00571 MCAM-205ENST00000526190 555 ntTSL 418.19■□□□□ 0.53e-14■■■■■ 34.3
DDX3XO00571 MCAM-207ENST00000528502 478 ntTSL 418.19■□□□□ 0.53e-14■■■■■ 34.3
DDX3XO00571 MCAM-216ENST00000530937 588 ntTSL 417.72■□□□□ 0.433e-14■■■■■ 34.3
DDX3XO00571 MCAM-212ENST00000529686 563 ntTSL 416.31■□□□□ 0.23e-14■■■■■ 34.3
DDX3XO00571 MCAM-213ENST00000530006 562 ntTSL 215.5■□□□□ 0.073e-14■■■■■ 34.3
DDX3XO00571 MCAM-203ENST00000525555 567 ntTSL 415.24■□□□□ 0.033e-14■■■■■ 34.3
DDX3XO00571 MCAM-215ENST00000530706 541 ntTSL 415.04■□□□□ -03e-14■■■■■ 34.3
DDX3XO00571 MCAM-217ENST00000534522 569 ntTSL 414.2□□□□□ -0.143e-14■■■■■ 34.3
DDX3XO00571 MCAM-208ENST00000528533 3164 ntTSL 513.49□□□□□ -0.253e-14■■■■■ 34.3
DDX3XO00571 MCAM-201ENST00000264036 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.383e-14■■■■■ 34.3
DDX3XO00571 MCAM-204ENST00000525586 4865 ntTSL 512.4□□□□□ -0.423e-14■■■■■ 34.3
DDX3XO00571 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.161e-7■■■■■ 34.3
DDX3XO00571 SLC7A8-211ENST00000528860 1499 ntTSL 215.37■□□□□ 0.051e-7■■■■■ 34.3
DDX3XO00571 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.031e-7■■■■■ 34.3
DDX3XO00571 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.071e-7■■■■■ 34.3
DDX3XO00571 SLC7A8-204ENST00000422941 3018 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.451e-7■■■■■ 34.3
DDX3XO00571 SH3GLB1-201ENST00000370558 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.627e-11■■■■■ 34.3
DDX3XO00571 SLC7A8-201ENST00000316902 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.71e-7■■■■■ 34.3
DDX3XO00571 SH3GLB1-203ENST00000535010 6227 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.827e-11■■■■■ 34.3
DDX3XO00571 SH3GLB1-205ENST00000616170 6456 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.877e-11■■■■■ 34.3
DDX3XO00571 SLC7A8-202ENST00000339733 3066 ntTSL 1 (best)8.72□□□□□ -1.011e-7■■■■■ 34.3
DDX3XO00571 SLC7A8-206ENST00000469263 3557 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.051e-7■■■■■ 34.3
DDX3XO00571 SLC7A8-213ENST00000532568 572 ntTSL 45.75□□□□□ -1.491e-7■■■■■ 34.3
DDX3XO00571 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.911e-17■■■■■ 34.2
DDX3XO00571 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.011e-17■■■■■ 34.2
DDX3XO00571 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.031e-17■■■■■ 34.2
DDX3XO00571 SMIM12-203ENST00000426886 2618 ntTSL 1 (best)13.06□□□□□ -0.321e-17■■■■■ 34.2
DDX3XO00571 RCL1-209ENST00000473230 441 ntTSL 37.56□□□□□ -1.29e-13■■■■■ 34.2
DDX3XO00571 TSPAN6-201ENST00000373020 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.221e-8■■■■■ 34.2
DDX3XO00571 TSPAN6-205ENST00000614008 900 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.261e-8■■■■■ 34.2
Retrieved 100 of 47,714 protein–RNA pairs in 1945.3 ms