Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGRNO00468 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGRNO00468 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGRNO00468 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGRNO00468 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AGRNO00468 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGRNO00468 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGRNO00468 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGRNO00468 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGRNO00468 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGRNO00468 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGRNO00468 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGRNO00468 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGRNO00468 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGRNO00468 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGRNO00468 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGRNO00468 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGRNO00468 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGRNO00468 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGRNO00468 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGRNO00468 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGRNO00468 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGRNO00468 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGRNO00468 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGRNO00468 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGRNO00468 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGRNO00468 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGRNO00468 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGRNO00468 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGRNO00468 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGRNO00468 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGRNO00468 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AGRNO00468 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGRNO00468 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGRNO00468 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGRNO00468 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGRNO00468 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGRNO00468 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGRNO00468 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGRNO00468 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AGRNO00468 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGRNO00468 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGRNO00468 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGRNO00468 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGRNO00468 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGRNO00468 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGRNO00468 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGRNO00468 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGRNO00468 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGRNO00468 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGRNO00468 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGRNO00468 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGRNO00468 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGRNO00468 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGRNO00468 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGRNO00468 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGRNO00468 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGRNO00468 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGRNO00468 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGRNO00468 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGRNO00468 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGRNO00468 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGRNO00468 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGRNO00468 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGRNO00468 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGRNO00468 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGRNO00468 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGRNO00468 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGRNO00468 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AGRNO00468 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGRNO00468 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGRNO00468 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGRNO00468 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGRNO00468 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGRNO00468 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGRNO00468 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGRNO00468 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGRNO00468 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGRNO00468 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGRNO00468 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGRNO00468 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGRNO00468 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGRNO00468 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGRNO00468 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGRNO00468 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGRNO00468 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGRNO00468 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGRNO00468 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AGRNO00468 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGRNO00468 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGRNO00468 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AGRNO00468 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGRNO00468 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGRNO00468 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGRNO00468 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGRNO00468 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGRNO00468 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGRNO00468 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGRNO00468 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGRNO00468 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms