Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIP1O00291 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIP1O00291 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIP1O00291 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIP1O00291 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIP1O00291 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIP1O00291 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIP1O00291 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIP1O00291 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIP1O00291 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIP1O00291 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIP1O00291 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIP1O00291 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIP1O00291 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIP1O00291 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIP1O00291 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIP1O00291 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIP1O00291 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIP1O00291 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIP1O00291 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIP1O00291 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HIP1O00291 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIP1O00291 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIP1O00291 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIP1O00291 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HIP1O00291 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIP1O00291 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIP1O00291 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIP1O00291 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIP1O00291 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HIP1O00291 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIP1O00291 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIP1O00291 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIP1O00291 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIP1O00291 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIP1O00291 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIP1O00291 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIP1O00291 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIP1O00291 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIP1O00291 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIP1O00291 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIP1O00291 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIP1O00291 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HIP1O00291 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HIP1O00291 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HIP1O00291 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HIP1O00291 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HIP1O00291 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HIP1O00291 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HIP1O00291 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HIP1O00291 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HIP1O00291 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HIP1O00291 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HIP1O00291 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HIP1O00291 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HIP1O00291 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HIP1O00291 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HIP1O00291 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HIP1O00291 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIP1O00291 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HIP1O00291 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIP1O00291 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIP1O00291 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIP1O00291 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIP1O00291 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIP1O00291 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIP1O00291 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIP1O00291 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIP1O00291 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIP1O00291 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIP1O00291 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIP1O00291 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIP1O00291 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIP1O00291 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIP1O00291 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIP1O00291 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIP1O00291 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIP1O00291 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIP1O00291 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIP1O00291 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIP1O00291 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIP1O00291 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIP1O00291 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIP1O00291 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIP1O00291 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIP1O00291 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIP1O00291 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIP1O00291 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIP1O00291 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HIP1O00291 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIP1O00291 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIP1O00291 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIP1O00291 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIP1O00291 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIP1O00291 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIP1O00291 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIP1O00291 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HIP1O00291 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HIP1O00291 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HIP1O00291 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms